При ФГУП «ВНИИ «Центр» действуют 2 диссертационных совета:

— диссертационный совет Д 411.007.01 по защите диссертаций на соискание ученых степеней кандидата и доктора наук по специальности:

• 08.00.05 — «Экономика и управление народным хозяйством» (экономические науки):
• (1.1) промышленность;
• (2) управление инновациями.

— специальный диссертационный совет ДС 411.011.03 по защите диссертаций на соискание ученых степеней кандидата и доктора наук по специальностям:

• 08.00.05 — «Экономика и управление народным хозяйством» (экономические науки):
• (1.1) промышленность;
• (2) менеджмент.
• 05.13.10 — «Управление в социальных и экономических системах» (технические науки).